Должны ли начисляться "северные" надбавки на зарплату сотрудников филиала (другого обособленного подразделения)?

Да, должны.

Трудовым кодексом РФ и Законом РФ от 19.02.1993 N 4520-1 "О государственных гарантиях и компенсациях для лиц, работающих и проживающих в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях" предусмотрены специальные компенсации за работу в особых климатических условиях:

- процентная надбавка к заработной плате за стаж работы в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях;

- районный коэффициент к заработной плате.

При расчете заработной платы должен применяться районный коэффициент и процентная надбавка, установленные к заработной плате для района или местности по месту выполнения работы. Под местом работы понимается место расположения структурного подразделения, в котором работает конкретный работник.

В ситуации, когда головной офис организации и структурные подразделения расположены в разных районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях, размер районного коэффициента и процентной надбавки определяется для каждого конкретного работника организации по месту расположения структурного подразделения, в котором работает этот работник.

Правовое обоснование

Согласно статье 148 ТК РФ оплата труда на работах в местностях с особыми климатическими условиями производится в порядке и размерах не ниже установленных трудовым законодательством и иными нормативными правовыми актами, содержащими нормы трудового права.

Статья 315 ТК РФ определяет, что оплата труда в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях осуществляется с применением районных коэффициентов и процентных надбавок к заработной плате.

На основании статьи 316 ТК РФ и статьи 10 Закона РФ от 19.02.1993 N 4520-1 "О государственных гарантиях и компенсациях для лиц, работающих и проживающих в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях" размер районного коэффициента и порядок его применения для расчета заработной платы работников организаций, расположенных в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях, устанавливаются Правительством Российской Федерации.

Согласно статье 317 ТК РФ и статье 11 Закона РФ от 19.02.1993 N 4520-1 лицам, работающим в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях, выплачивается процентная надбавка к заработной плате за стаж работы в данных районах или местностях. Размер процентной надбавки к заработной плате и порядок ее выплаты устанавливаются в порядке, определяемом статьей 316 Кодекса для установления размера районного коэффициента и порядка его применения.