Будет ли это считаться прогулом?

Если Ваш отпуск предусмотрен графиком отпусков, то Вы можете уйти в отпуск без приказа, и это не будет считаться прогулом. Если Ваш отпуск не предусмотрен графиком отпусков, то Вы можете уйти в отпуск, если из подписи генеральный директор явно следует его согласие предоставить Вам отпуск.

Правовое обоснование

Согласно ст. 123 ТК РФ очередность предоставления оплачиваемых отпусков определяется ежегодно в соответствии с графиком отпусков, утверждаемым работодателем с учетом мнения выборного органа первичной профсоюзной организации не позднее, чем за две недели до наступления календарного года.

График отпусков обязателен как для работодателя, так и для работника.